育种管理与数据分析定制化平台是以云平台为基础,为科研以及生产实践定制的系统。该系统综合运用动物育种原理和计算机网络技术,包括个体与系谱管理,动物生长阶段管理,常规遗传参数分析以及分子育种分析等综合功能,为科研及生产人员提供管理及决策上的数据支持。

 

为更好解决目前国内动物育种尤其是动物育种面临的主要问题,推动和发展中国现代化的动物育种研究和产业转化进程, VSNC公司最新推出整合 ASReml分析功能的定制化动物管理及数据分析平台合作研发项目。

育种管理与数据分析定制化平台是以云平台为基础, 为科研以及生产实践定制的系统。该系统综合运用动物育种原理和计算机网络技术,包括个体与系谱管理,动物生长阶段管理,常规遗传参数分析以及分子育种分析等综合功能,为科研及生产人员提供管理及决策上的数据支持。

 

  • 表型数据库平台构建

设置系谱管理、育种数据管理两大模块。制定生产性能测定及繁殖性能相关的上传、下载模板;对采集的信息进行整理、编辑,构建表型数据库。

  •  遗传参数评估平台

结合已有数据利用动物模型BLUP法,通过后台VSN产品ASREML软件,采用云计算技术进行遗传统计分析,并自动生成报表,指导生产实践工作。其主要模块包括:遗传参数评估模块、选种选配模块。

  • 分子数据库构建

分子标记数据库包括基因组数据可视化、基因组数据管理界面等。能够显示标记数据的质量和特点,实现分子数据转化为矩阵后的存储、查询以及后期基因组数据分析的应用。

  • 基因组数据分析平台

基因组数据分析平台功能将包括分子数据清洗、整理,数值矩阵工具开发以及全基因

计算,工具自动化分析,并最终通过全基因组选择制定育种方案。

 

最低服务器配置要求:

  • OS                          : Linux
  • RAM                      : 16 GB
  • Storage                 : 40GB SSD
  • vCPU                     : 8
  • Data Transfer     : 1TB

如果需要进行复杂计算,推荐服务器配置:

  • OS                          : Linux
  • RAM                      : more than  16 GB
  • Storage                 : more than  40GB SSD
  • vCPU                     : 8
  • Data Transfer     : more than 3TB

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