R与ASreml-R遗传参数评估培训会

培训时间:2017年9月23日-24日(星期六、日)上午9:00-12:00 至 下午1:30-5:30

培训地点:北京海淀区善缘街1号(中关村) 立方庭大厦二层

报到时间:2017年9月23日(星期六)上午8点

优惠报名截至日期:2017年9月13日

讲师:邓飞 (VSNC 技术总监)

培训亮点:遗传参数评估、BLUP、 GBLUP 及 全基因组选择(GS)

软件赠送:免费提供正版ASreml 软件1年使用授权

主办方:北京维斯恩思软件有限责任公司 (VSNC)

学员人数:35人以内


背景:

ASreml是拟合线性混合模型的优秀数据分析软件,由NSW Department of Primary Industries的Arthur Gilmour博士开发,可利用灵活的混合线性模型和广义线性模型来处理大规模的数据,实现大数据高效、快速的分析。ASreml可对数量性状、阈值性状、分类性状、SNP标记等多个性状进行分析,并可实现固定效应、随机效应值的预测以及显著性检验、遗传参数的估计、全基因组选择等。目前,ASreml软件已在世界范围内广泛地应用于动物、水产、林业、作物以及医学等多个领域的研究。

ASreml-R 作为ASreml 软件的版本之一,结合ASreml的混线性模型优势与R的灵活性,近年来被越来越多的育种科研工作者所重视。因此,应广大科研工作者的需求,北京维斯恩思软件有限责任公司(VSNC)作为ASreml在华唯一子公司,拟定于2017年9月23日-24日在北京举办《R与ASreml-R 遗传参数评估培训会》,共同探讨ASreml-R在育种领域研究的统计分析方法及实际应用案例。


培训内容:

Day 1: 9月23日
上午 9:00-12:00
R语言介绍

  • R语言软件安装、读取数据
  • R语言数据清洗及汇总统计
  • R语言常用作图介绍
ASreml-W 及ASreml-R简介及应用

  • 在遗传参数评估中的应用(动物、水产、林木、作物)
  •  混合线性模型理论介绍
  • ASreml-W及配置context
  • 安装ASreml-R
  • ASreml语法解释及案例解析
下午 1:30-5:30
ASreml遗传模型

  • 如何分析半同胞家系模型(计算遗传力及配合力)
  • 如何分析个体动物模型(包括公畜模型、公畜-母畜模型、动物模型)
  • 如何计算近交系数和亲缘关系系数
  • 如何计算遗传力以及标准误
  • 如何计算母体效应以及永久环境效应
  • 如何计算BLUP育种值及可靠性
  • 如何评价固定效应和随机效应的显著性(Wald和LRT检验)
  • 如何评价和比较模型的优劣(AIC、BIC、LRT),如何调整和优化模型
Day 2: 9月24日
上午 9:00-12:00
多性状分析

  • 性状相关分析(表型相关、遗传相关、环境相关)
  • 如何设置初始值及解决多性状分析不收敛的情况
  • 性状相关的显著性检验
阈值性状的遗传参数评估(遗传力、育种值)
多地点试验(MET)数据分析(G by E)
空间分析及模型的比较和优化(LRT、AIC、BIC)
下午 1:30-5:30
高通量SNP信息在数据分析中的应用

  • SNP与表型性状的关联分析(找到显著SNP位点进行分子标记辅助选择)
  • GBLUP育种值估计
  • 一步法GBLUP(one-step GBLUP)
  • 如何利用SNP信息进行GS分析(Genomic Selection)
ASreml国际资格认证考试(由VSNI授权)

注册费:

2017年9月13日前注册报名 2017年9月13日后注册报名(如有剩余名额)
3200元/人 3500元/人
团体报名:3人及以上同时注册报名可获得1免费参会名额

注: 注册费包含培训费、讲义费、午餐费、学习资料费等,并赠送ASreml软件一年使用权(包含技术服务支持)。


参会须知:

1. 会务组可协助安排住宿,费用自理;

2. 培训期间免费提供午餐;

3. 请各位老师同学自备笔记本电脑;

4. 报名付费后工作人员会为各位老师及同学申请并发送软件(1年使用权)(邮件),请各位老师注意查收邮件,工作人员将协助参会老师在会前10天内进行安装。由于软件绑定电脑,请各位参会者携带安装好软件的电脑参加培训。


报名及付费方式:

参会人员请选择参会场次,在报名截止日期前在线提交注册信息或下载附件《报名回执》,报名回执表请发送至邮箱:China@vsni.co.uk并将报名费汇入以下账户(报名时间以收到汇款时间为准):

开户名: 北京维斯恩思软件有限责任公司

开户行: 中国建设银行北京中关村分行

帐 号 : 1100 1007 3000 5301 7767

注:汇款时请务必注明单位、姓名(例如:中国农业大学张三注册费);发票及通知(加盖公章)将于会议当天统一发放。

会务联系人:张娟(13121623804 / 010-88400822 / 010-62680244)

邮箱:China@vsni.co.uk